MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	459284226
2	NC_020450	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	459284226
3	NC_020450	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	459284226
4	NC_020450	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	459284226
5	NC_020450	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284226
6	NC_020450	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	459284226
7	NC_020450	CGG	2	6	197	202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284226
8	NC_020450	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284226
9	NC_020450	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284226
10	NC_020450	AACTG	2	10	258	267	40 %	20 %	20 %	20 %	459284226
11	NC_020450	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	459284226
12	NC_020450	AGC	2	6	305	310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284226
13	NC_020450	TTGCTG	2	12	422	433	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	459284226
14	NC_020450	TATT	2	8	461	468	25 %	75 %	0 %	0 %	459284226
15	NC_020450	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284226
16	NC_020450	ATGC	2	8	502	509	25 %	25 %	25 %	25 %	459284226
17	NC_020450	TGAC	2	8	527	534	25 %	25 %	25 %	25 %	459284226
18	NC_020450	TTC	2	6	561	566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284226
19	NC_020450	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	459284226
20	NC_020450	T	6	6	706	711	0 %	100 %	0 %	0 %	459284226
21	NC_020450	AAT	2	6	784	789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284226
22	NC_020450	ACT	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284226
23	NC_020450	A	6	6	1059	1064	100 %	0 %	0 %	0 %	459284226
24	NC_020450	A	7	7	1099	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	459284226
25	NC_020450	ATT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284226
26	NC_020450	TTG	2	6	1151	1156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284226
27	NC_020450	GGC	2	6	1258	1263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284226
28	NC_020450	CA	3	6	1270	1275	50 %	0 %	0 %	50 %	459284226
29	NC_020450	TAA	2	6	1542	1547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284227
30	NC_020450	TTGAAG	2	12	1631	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284227
31	NC_020450	TCAA	2	8	1681	1688	50 %	25 %	0 %	25 %	459284227
32	NC_020450	T	6	6	1692	1697	0 %	100 %	0 %	0 %	459284227
33	NC_020450	ATA	2	6	1706	1711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284227
34	NC_020450	TTA	2	6	1750	1755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284227
35	NC_020450	GCT	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284227
36	NC_020450	AGA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
37	NC_020450	ATCA	2	8	2142	2149	50 %	25 %	0 %	25 %	459284227
38	NC_020450	ATG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284227
39	NC_020450	AAG	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
40	NC_020450	TCA	2	6	2198	2203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284227
41	NC_020450	TTA	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284227
42	NC_020450	TTGA	2	8	2254	2261	25 %	50 %	25 %	0 %	459284227
43	NC_020450	TGC	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284227
44	NC_020450	GTA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284227
45	NC_020450	AGGT	2	8	2450	2457	25 %	25 %	50 %	0 %	459284227
46	NC_020450	GAA	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
47	NC_020450	AAG	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
48	NC_020450	TGAT	2	8	2531	2538	25 %	50 %	25 %	0 %	459284227
49	NC_020450	GAA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284227
50	NC_020450	GTAC	2	8	2653	2660	25 %	25 %	25 %	25 %	459284227
51	NC_020450	AATT	2	8	2662	2669	50 %	50 %	0 %	0 %	459284227
52	NC_020450	TA	3	6	2783	2788	50 %	50 %	0 %	0 %	459284228
53	NC_020450	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
54	NC_020450	A	7	7	2846	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
55	NC_020450	TTA	2	6	2862	2867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
56	NC_020450	CTT	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
57	NC_020450	GAAA	2	8	2901	2908	75 %	0 %	25 %	0 %	459284228
58	NC_020450	GCA	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284228
59	NC_020450	TAT	2	6	2983	2988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
60	NC_020450	ACA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284228
61	NC_020450	CAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284228
62	NC_020450	GAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284228
63	NC_020450	AGA	2	6	3081	3086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
64	NC_020450	CTG	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
65	NC_020450	T	6	6	3123	3128	0 %	100 %	0 %	0 %	459284228
66	NC_020450	A	6	6	3216	3221	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
67	NC_020450	GAA	2	6	3238	3243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
68	NC_020450	ACT	2	6	3266	3271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284228
69	NC_020450	GTC	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
70	NC_020450	GAA	2	6	3373	3378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
71	NC_020450	TGA	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
72	NC_020450	CTT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
73	NC_020450	AAAT	2	8	3629	3636	75 %	25 %	0 %	0 %	459284228
74	NC_020450	CTG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
75	NC_020450	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
76	NC_020450	T	6	6	3738	3743	0 %	100 %	0 %	0 %	459284228
77	NC_020450	TAG	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
78	NC_020450	GCT	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284228
79	NC_020450	GAAA	2	8	3795	3802	75 %	0 %	25 %	0 %	459284228
80	NC_020450	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
81	NC_020450	T	6	6	3874	3879	0 %	100 %	0 %	0 %	459284228
82	NC_020450	AAT	2	6	3904	3909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284228
83	NC_020450	GAT	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
84	NC_020450	TCT	2	6	3933	3938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
85	NC_020450	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
86	NC_020450	A	7	7	4029	4035	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
87	NC_020450	A	6	6	4151	4156	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
88	NC_020450	A	7	7	4161	4167	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
89	NC_020450	T	6	6	4328	4333	0 %	100 %	0 %	0 %	459284228
90	NC_020450	TGA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
91	NC_020450	TTA	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
92	NC_020450	TGT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284228
93	NC_020450	TTG	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284228
94	NC_020450	TAA	2	6	4467	4472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284228
95	NC_020450	AT	3	6	4473	4478	50 %	50 %	0 %	0 %	459284228
96	NC_020450	GAA	2	6	4546	4551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
97	NC_020450	TGA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
98	NC_020450	A	7	7	4619	4625	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
99	NC_020450	CTTT	2	8	4639	4646	0 %	75 %	0 %	25 %	459284228
100	NC_020450	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
101	NC_020450	A	6	6	4754	4759	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
102	NC_020450	TTC	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
103	NC_020450	A	6	6	4766	4771	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
104	NC_020450	AAG	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
105	NC_020450	TTG	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284228
106	NC_020450	GAA	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
107	NC_020450	A	7	7	4874	4880	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
108	NC_020450	TGA	2	6	4881	4886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
109	NC_020450	T	6	6	4895	4900	0 %	100 %	0 %	0 %	459284228
110	NC_020450	A	6	6	4946	4951	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
111	NC_020450	TAT	2	6	4952	4957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
112	NC_020450	AAG	3	9	5183	5191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
113	NC_020450	TGA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
114	NC_020450	ATG	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
115	NC_020450	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
116	NC_020450	AGAC	2	8	5320	5327	50 %	0 %	25 %	25 %	459284228
117	NC_020450	TGA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
118	NC_020450	AGT	2	6	5386	5391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
119	NC_020450	TGA	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
120	NC_020450	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
121	NC_020450	TCT	2	6	5476	5481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284228
122	NC_020450	ATT	2	6	5483	5488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284228
123	NC_020450	AAG	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
124	NC_020450	A	6	6	5606	5611	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
125	NC_020450	TTTA	2	8	5624	5631	25 %	75 %	0 %	0 %	459284228
126	NC_020450	ATCA	2	8	5665	5672	50 %	25 %	0 %	25 %	459284228
127	NC_020450	ATG	2	6	5714	5719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284228
128	NC_020450	A	7	7	5775	5781	100 %	0 %	0 %	0 %	459284228
129	NC_020450	AAG	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284228
130	NC_020450	TGAA	2	8	5825	5832	50 %	25 %	25 %	0 %	459284228
131	NC_020450	ATGA	2	8	5989	5996	50 %	25 %	25 %	0 %	459284228
132	NC_020450	AATTGA	2	12	6202	6213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	459284229
133	NC_020450	A	7	7	6238	6244	100 %	0 %	0 %	0 %	459284229
134	NC_020450	GCA	2	6	6245	6250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284229
135	NC_020450	A	7	7	6283	6289	100 %	0 %	0 %	0 %	459284229
136	NC_020450	TGA	2	6	6307	6312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284229
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397	NC_020450	GAA	2	6	20140	20145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284240
398	NC_020450	TGA	2	6	20217	20222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284240
399	NC_020450	TAC	2	6	20232	20237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284240
400	NC_020450	AAT	2	6	20270	20275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284240
401	NC_020450	A	7	7	20506	20512	100 %	0 %	0 %	0 %	459284241
402	NC_020450	A	7	7	20575	20581	100 %	0 %	0 %	0 %	459284241
403	NC_020450	AAT	2	6	20597	20602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284241
404	NC_020450	ATGGA	2	10	20721	20730	40 %	20 %	40 %	0 %	459284242
405	NC_020450	AGTGG	2	10	20783	20792	20 %	20 %	60 %	0 %	459284242
406	NC_020450	T	6	6	20825	20830	0 %	100 %	0 %	0 %	459284242
407	NC_020450	TTG	2	6	20886	20891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284242
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410	NC_020450	A	6	6	21101	21106	100 %	0 %	0 %	0 %	459284242
411	NC_020450	AG	3	6	21134	21139	50 %	0 %	50 %	0 %	459284242
412	NC_020450	CAA	2	6	21141	21146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284242
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415	NC_020450	AAT	2	6	21214	21219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284242
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419	NC_020450	ATT	2	6	21376	21381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284242
420	NC_020450	TGA	2	6	21547	21552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284242
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424	NC_020450	AAAT	2	8	21756	21763	75 %	25 %	0 %	0 %	459284242
425	NC_020450	GGTA	2	8	21817	21824	25 %	25 %	50 %	0 %	459284242
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428	NC_020450	AT	3	6	21924	21929	50 %	50 %	0 %	0 %	459284242
429	NC_020450	TGG	2	6	21946	21951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284242
430	NC_020450	CAGATA	2	12	21954	21965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	459284242
431	NC_020450	ATG	2	6	21969	21974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284242
432	NC_020450	GAT	2	6	22034	22039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284242
433	NC_020450	ATT	2	6	22152	22157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284243
434	NC_020450	GGT	2	6	22168	22173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284243
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